凭祥市的教育情况，明代以前无考。清同治末年（1874年）。成立文昌学会，为地方学士讲学之所。光绪三年（1877年）.创办届远书院。三十二年，建凭祥土州小学堂1所。民国9年（1920年），全县建有小学7所。民国32年。建立国民中学。民国38年，全县有小学68所、初级中学1所，中小学教师126人，在校中小学生2687人。解放后，党和政府重视教育事业。年度教育经费1957年6.45万元，1985年161.34万元，增长24倍。1985年，全市有小学199所、中学5所，中小学教师621人，在校中小学生14858人，比1949年分别增长1.93倍、4倍、3.93倍和4.53倍。还有师范、卫生等中等专业学校各1所。1984年，南宁地区行政公署发给凭祥市“符合基本扫除少青壮年文盲单位标准”合格证书；1986年，广西壮族自治区人民政府发给凭祥市“普及初等教育标准”合格证书。
解放后，1957年以前教学正常，质量较好。1958年“大跃进”期间，教师和中学生被抽去“大炼钢铁”，教学不正常。三年困难时期，教学受到影响。1966年下半年“文化大革命”开始以后，学校停课闹“革命”，部分教师被批斗。1968年下半年起复课闹“革命”，学校教育强调“思想革命化”，不重视基础知识的教学，教材、教师的质量不高，上课时间不足40%，取消考试，学生学习缺乏动力和压力，教学质量严重下降，小学毕业生中很多不会四则运算，许多中学生毕业后连写家信都觉得困难。1975年，凭祥市13至50岁人口中文盲占44.9%。1978年起，教育工作拨乱反正，教学渐趋正常。
1985年，凭祥市教育投资人均19.88元，每千人有教师7.65人，小学升初中率54.1%，初中升高中率42.6%，高中升大专（含中专）率8.93%。
2006年凭祥市普通高中招生483人，在校生1259人，毕业生273人，普通初中招生1810人，在校生5005人，毕业生1386人。普通小学招生1432人，在校生8192人，毕业生1899人，农村义务教育阶段公办学校学生实现免费上学。