徐州生物工程职业技术学院前身是创建于1956年的江苏省徐州农业学校。2012年经江苏省人民政府批准、教育部备案，升格为“徐州生物工程职业技术学院”，为公办普通高等学校。学院目前是苏北唯一的农业类普通高等院校、全省唯一的生物工程类职业技术学院。

目前，学校占地615亩，建筑面积21万平方米。现有教职工335人，专任教师260人，其中副教授以上高级职称74人，博士、硕士研究生137人，“双师型”教师123人。建有生物技术、生物制药、园艺园林、动物医院、信息机电等30个实训中心，200多个校外实训基地，专业设备总值4300万元，馆藏图书25万册。

学院设有农林工程系、动物工程系、生物工程系、信息工程系、机械工程系、电气工程系、基础部等6系1部，开办26个大专专业，形成了以生物工程类专业为特色、农林牧医类专业为优势、机电信息类专业为支撑的专业结构。有2个中央财政支持专业（畜牧兽医、园林技术）、1个江苏省重点专业群（生物技术及应用专业群）、3个牵头服务徐州“四大千亿元产业”重点专业（园艺、园林、生物制药）、1个徐州市重点实验室（现代农业生物技术实验室）、1个中心（徐州市风景园林工程研究中心），13个省市品牌、特色和示范专业。

学院坚持“立足徐州，面向淮海，建设职教名校”的发展战略，坚持面向社会、紧贴市场的办学方向，不断推进教学改革，培养高素质技术技能型人才，形成校企合作、工学结合的人才培养模式。紧密对接企业，实施“教学合作、人才合育、文化互融、事业互促”的策略，与扬子江药业、正大集团、中粮集团、温氏集团、广西桂柳等100多家大型企业建立了紧密型深层次合作关系，开展“订单式”培养。注重学生综合素质的提高和实践能力、创业能力的培养，毕业生有较强的就业竞争力和发展后劲。建校以来，共培养大中专毕业生4万多名，据不完全统计，目前徐连地区70%的农技推广干部和30%的乡镇党政主要干部均毕业于我院，就业率一直保持在98%以上。

学院是农业部A等学校、江苏省技能型紧缺人才培训基地、国家级职业技能鉴定站。现为全国农业职教专业委员会常务理事单位、江苏省农牧职业院校生物工程类专业组长单位、江苏省职业教育教科研中心组组长单位。近年来，获得“全国服务农村青年增收成才先进集体”“中国可持续发展教育示范学校”“江苏省职业教育先进单位”“江苏省文明单位”“江苏省平安校园”“江苏省教育系统先进基层党组织”“江苏省教育回报社会先进单位”“江苏省挂县强农富民工程先进单位”“江苏省园林式单位”“江苏省花园式单位”“徐州市文明单位标兵”等荣誉称号。